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EGAPx

EGAPxをローカルDockerで動かす

2026.06.05
EGAPxGene predictionSoftware
Genome submission

NCBI に配列データを登録する

2025.09.30
Genome submissionMemo
Genome submission

ENAに配列データを登録する

2025.09.21
Genome submissionMemo
Gene prediction

NCBIにアノテーションをリクエストする

2025.08.14
Gene predictionMemo
Memo

Jobが終わったらメールちょうだい

2024.12.29
Memo
Memo

top, htop:実行中のプロセスを表示させるコマンド

2024.12.29
Memo
AUGUSTUS

AUGUSTUSを用いた非モデル生物ゲノムへの遺伝子アノテーション

2024.12.28
AUGUSTUSGene predictionSoftware
Seqkit

fasta, fastq ファイルを扱うときに便利なseqkit

2024.12.28
SeqkitSoftware
Software

Codeml(PAML)を用いた dN dS の算出

2024.12.26
Software

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fasta, fastq ファイルを扱うときに便利なseqkit
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NCBI に配列データを登録する
2025.11.18Genome submissionMemo
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2025.09.21Genome submissionMemo
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