yawako

Uncategorized

VS CodeのRemote SSHでサーバーに接続する(Windows・WSL・遺伝研スパコンで詰まる人向け)

EGAPx

EGAPxをローカルDockerで動かす

Genome submission

NCBI に配列データを登録する

Genome submission

ENAに配列データを登録する

Gene prediction

NCBIにアノテーションをリクエストする

Memo

Jobが終わったらメールちょうだい

Memo

top, htop:実行中のプロセスを表示させるコマンド

AUGUSTUS

AUGUSTUSを用いた非モデル生物ゲノムへの遺伝子アノテーション

Seqkit

fasta, fastq ファイルを扱うときに便利なseqkit

Software

Codeml(PAML)を用いた dN dS の算出