進化ゲノミクス・比較ゲノミクス

川口 也和子

Yawako W KAWAGUCHI

国立遺伝学研究所　博士研究員

ゲノムのサイズや構造、塩基配列が進化の過程でどのように変化するのかに興味があります。単細胞藻類から脊椎動物まで、さまざまな生物を対象に、比較ゲノム解析やゲノムアセンブリ、分子進化解析などを行っています。

川口也和子の写真 池でプランクトンネットを使って採集しているところ

論文

査読付き論文とプレプリント（新しい順）。

2026

  1. Shifts in high-light acclimation strategies associated with molecular evolutionary rates in duckweeds

    Yawako W KAWAGUCHI, Masaru Kono, Minako Isoda, Kensuke Kawade, Hiromitsu Tabeta, Ryosuke Sasaki, Akira Oikawa, Masami Y. Hirai, Evelina Josephine, Levina Valerie, Natsu Katayama

    プレプリント bioRxiv doi:10.64898/2026.09.07.749874

  2. Tracing genome size dynamics in sharks and rays with inclusive sequence analysis by the Squalomix Consortium

    Shigehiro Kuraku, Yawako W KAWAGUCHI, Taiki Niwa, Ryo Misawa, Yohey Ogawa, Mitsutaka Kadota, Kazuhiro Saito, Waichiro Godo, Tatsuya Sakamoto, Wataru Takagi, Sachiko Isobe, Kenta Shirasawa, Akane Kawaguchi

    Genome Research 36(8): 1708–1723 doi:10.1101/gr.281149.125 プレプリント版

  3. Shark sexing from forensic, archival, and developmental samples using sex-linked DNA markers

    Akane Oishi, Yawako W KAWAGUCHI, Taiki Niwa, Yoshinobu Uno, Shigehiro Kuraku

    プレプリント bioRxiv doi:10.64898/2026.05.02.722412

  4. Improved genome assembly of whale shark, the world’s biggest fish: revealing intragenomic heterogeneity in molecular evolution

    Yawako W KAWAGUCHI, Rui Matsumoto, Shigehiro Kuraku

    GigaScience 15: giag014 doi:10.1093/gigascience/giag014 プレプリント版

2025

  1. A single episode of sexual reproduction can produce large variation in population growth rates under dual stressors

    Yawako W KAWAGUCHI, Masato Yamamichi

    Journal of Evolutionary Biology 38(6): 778–785 doi:10.1093/jeb/voaf041 プレプリント版 プレスリリース

  2. Nationwide diversity of symbolic “city flowers” in Japan is increasing

    Yoichi Tsuzuki*, Haruna Ohsaki*, Yawako W KAWAGUCHI*, Sayaka Suzuki, Shogo Harada, Yurie Otake, Naoto Shinohara, Koki R. Katsuhara

    Ecological Research 40(4): 463–474 doi:10.1111/1440-1703.12540 プレスリリース

2024

  1. Diversity of genome size and chromosome number in homothallic and heterothallic strains of the Closterium peracerosum–strigosum–littorale complex (Desmidiales, Zygnematophyceae, Streptophyta)

    Yuki Tsuchikane, Misaki Watanabe, Yawako W KAWAGUCHI, Koichi Uehara, Tomoaki Nishiyama, Hiroyuki Sekimoto, Takashi Tsuchimatsu

    Journal of Phycology 60(3): 654–667 doi:10.1111/jpy.13457

2023

  1. Extensive Copy Number Variation Explains Genome Size Variation in the Unicellular Zygnematophycean Alga, Closterium peracerosum–strigosum–littorale Complex

    Yawako W KAWAGUCHI, Yuki Tsuchikane, Keisuke Tanaka, Teruaki Taji, Yutaka Suzuki, Atsushi Toyoda, Motomi Ito, Yasuyuki Watano, Tomoaki Nishiyama, Hiroyuki Sekimoto, Takashi Tsuchimatsu

    Genome Biology and Evolution 15(8): evad115 doi:10.1093/gbe/evad115

2019

  1. Plant adaptation and speciation studied by population genomic approaches

    Masaru Bamba, Yawako W KAWAGUCHI, Takashi Tsuchimatsu

    Development, Growth & Differentiation 61(1): 12–24 doi:10.1111/dgd.12578

* 筆頭著者として同等に貢献。

経歴

職歴

  • 2023年10月 – 現在 遺伝研博士研究員
    国立遺伝学研究所 分子生命史研究室（工樂樹洋研究室）
  • 2023年4月 – 2023年9月 特任研究員
    国立遺伝学研究所 理論生態進化研究室（山道真人研究室）
  • 2020年4月 – 2023年3月 日本学術振興会特別研究員（DC1）
    日本学術振興会

学歴

受賞

  • 2025年8月 口頭発表最優秀賞 — 日本進化学会
  • 2024年7月 GBE Best Student Paper Award — Society for Molecular Biology and Evolution
  • 2019年8月 ポスター優秀賞 — 日本進化学会

研究費

  • 2026年10月 – 2027年9月 クリタ水・環境科学振興財団 萌芽的研究(b)
    淡水微細藻類ミカヅキモの有性生殖にみるゲノム多様性維持機構
  • 2024年7月 – 2026年3月 科研費 研究活動スタート支援
    脊椎動物の全ゲノム比較から迫るゲノム構造の進化速度の多様性
  • 2020年4月 – 2023年3月 科研費 特別研究員奨励費
    接合藻ヒメミカヅキモの生殖様式の進化：生殖様式転換実験と全ゲノム解析から探る

その他の活動

PhyloWeaver
ブラウザで動く系統樹エディタ。ドラッグ＆ドロップで系統樹を並べ替えたり注釈を付けたりして、論文用の図やデータを書き出せます。 GitHub Zenodo
ブログ「だれかのためのバイオインフォマティクス」
ゼロから少しずつできるようになったバイオインフォマティクスのHow-toを、同じように始めたばかりの人のために書いています。